如果患有卵巢囊肿，并且想要用手术的方法来进行治疗的情况下，一般是不会影响到将来的生育，但是在手术期间，要让医生尽量选择保留卵巢和卵巢的功能，这样才能不影响将来的怀孕，如果对卵巢有很大的损伤，或者影响了将来的卵巢功能，就很有可能会导致影响到怀孕的，出现这种情况，要咨询主治医生，要根据自己的实际情况来进行确定。