巧克力囊肿的原因和分娩、生理原因、内分泌因素、输卵管梗阻、子宫内膜异常、频繁的性生活、流产、宫外孕等都是有关系的。巧克力囊肿可能会导致女性月经不调，严重的会在一定程度上影响月经，引起痛经和不孕的现象。出现巧克力囊肿，需要及时到正规的医院治疗。巧克力囊肿要在经期避免剧烈活动，另外，要避免口服避孕药，应该尽量去避免人工流产，更好地预防巧克力囊肿。