如果患有巧克力囊肿，很可能会出现腹部疼痛等症状，但是单凭从腹部疼痛，是不能确定巧克力囊肿的。建议首先去医院做详细的检查，可以做腹部B超检查，也可以做腹部CT，只有明确病因，确诊以后，才能够对症治疗，这期间如果疼痛比较严重，可以酌情使用一些解热镇痛药，或者去医院，根据情况来进行治疗。