亚急性甲状腺炎临床表现很严重，会有高烧，一般到晚上会烧得更厉害一些，会有脖子疼，颈部的疼痛非常剧烈，咽东西的时候更加显著，这个疾病是自限性疾病，只能对症治疗，没有一个特意治疗，该好的时候就好了。

对于多数的亚急性甲状腺炎的患者，病程一般是1~3个月左右，基本上就能够好转了，可能最严重的高烧、疼痛，在一个月时间里面是比较显著的，而后就会逐渐减轻。

但是也有一部分患者，亚急性甲状腺炎此起彼伏，甲状腺局部出现了炎症会疼痛，或者出现触痛结节、高烧，过了一段时间结节消退了，在甲状腺另一个部位又出现一个疼痛的结节，这样患者病程可能就会迁延，部分患者在一段时间里面此起彼伏，炎症可能会持续六个月到一年的时间。

好好休息，适当地限制碘的摄入量，避免上呼吸道感染，可能对于缩短病程都会有帮助，但事实上更重要的是这个疾病在得病的时候，就决定了它的病程如何了，这就是自限性疾病的特征。