甲状腺结节手术的后遗症可能有局部会有皮肤的斑红；第二个可能会引起甲状腺功能的减退，有的甚至是永久性的甲状腺功能减退，需要长期口服甲状腺素来补充；第三个甲状腺结节术中有可能会损伤甲状旁腺，引起甲状旁腺功能的减退，引起临床出现低钙抽搐的症状，这个有可能会影响喉返神经，引起声音嘶哑等常见的一些并发症。但是目前来说，甲状腺结节的手术尤其是微创手术，很少有手术的一些后遗症，外科开放性的手术并发症的发生率也很低。