引起肺栓塞最常见的原因是血栓，大约有70%-95%的患者是由于深静脉血栓脱落后，随血液循环进入肺动脉及其分支，然后引起肺栓塞。 患者如长期卧床、下肢制动，都会导致深静脉血栓的发生。所以说原发部位以下肢深静脉为主。

另外，有其他栓子也可以引起肺栓塞，比如说脂肪栓、空气栓、羊水栓、寄生虫栓以及细菌性的栓塞，还有就是心脏赘生物脱落，这些均可以引起肺栓塞。