肩膀酸痛的原因有很多，从睡完觉以后肩膀酸疼，常见是肩锁关节的一些炎症，包括肩关节肌肉的一些痉挛的表现，对于肩锁关节的这种炎症，其实在平时临床上也是比较常见，肩锁关节的部位是肩峰和锁骨远端所接触的这个地方，它是有微动的这个活动度的，在睡觉如果错位的时间比较长，肩膀受到的压力比较大，又加上身体的状态不太好，可能就会诱发出整个肩锁关节的不适感觉。

这种疼痛有可能是非常剧烈的，伴随疼痛的，是肩锁关节的一些不太稳定的表现，一些严重的，会查到有琴键征，有的时候琴键征是在肩锁关节脱位的时候才能查得出来，但是对于一些肩锁关节炎的患者，琴键征也是可以诱发的，这是肩关节疼痛的一个原因。

还有一个原因就是肩关节肌肉的一些问题，比如之前做了一些锻炼或者做了一些运动，肩关节的肌肉相对比较痉挛，睡觉之前没有做一些拉伸或者舒展，可能这个肌肉会更加的不舒服。另外，对于肩周炎或者肩袖损伤的患者，如果长时间的压迫，睡觉起来以后，肩关节疼痛的这种症状也是会比较明显。