肠镜是常用的肠道的检查方法，使用肠镜能观察肠道内的情况，这是能够确诊肠道疾病的最主要的方法，但是除了肠镜现在还有一款叫胶囊内镜，它可以不用做肠镜，直接就口服一颗胶囊，从上消化道所经过的地方都可以看到，但价格会比较贵。

检查肠道还有的方法，有时候可以做腹部的彩超或者是全腹部的CT，但是这样漏诊率会比较高，可能确诊率会比较低，因为肠道是无时不刻在蠕动，CT平扫都是按照层次进行分层，有可能在肠道蠕动的时候找到了病灶，就在分开的那一段，有可能就查不到了。

直肠还有一个检查的方法，就是肛门的指诊，最主要的检查是直肠，虽然肠道检查方法很多，但是首选是肠镜检查，因为在肠镜下可以直观清晰的，观察到肠道黏膜的情况，是否有息肉，肿瘤或者是炎症性的肠病，而在胶囊内镜或者下消化道造影，是不能够取活检的。