肠镜分为结肠镜和小肠镜，一般准备行肠镜检查时，要完善一些血的检测，需要查免疫四项，部分医院要求查肝功能、凝血功能等，还可以查血常规。

如果做无痛肠镜，会需要做心电图，等检查结果齐备，预约肠镜，在肠镜检查前一天需要清肠，一般是服用复方聚乙二醇电解质散，待肠道排出的是清水或黄水而没有粪质，才算准备充分。

在检查时，可以选择普通肠镜或者是无痛肠镜检查。无痛肠镜会有麻醉师输入一定量的麻醉剂，在整个肠镜检查过程中间是没有知觉的，处于睡眠状态，也没有痛苦的回忆。

肠镜检查的时候由医生操作内镜，进入需要观察的肠道部位，观察黏膜形态，然后酌情进行病理组织检查，也可以进行内镜下治疗，如息肉切除，还有一些黏膜剥离等。