大便后肚子不舒服有可能是慢性结肠炎或者肠易激综合征，可以做肠镜检查明确诊断。

如果肠镜检查看到肠道黏膜出现潮红、水肿或糜烂等改变，就可以诊断为慢性结肠炎。如果看到肠道粘膜无任何器质性改变就可以诊断为肠易激综合征。

治疗方面可以口服益生菌调节肠道菌群，另外慢性结肠炎的患者可以用中医的外治，比如中药灌肠或水疗的方式进行治疗，可以起到不错的疗效。同时平时要饮食，要以清淡的易消化饮食为主，不能吃辛辣，刺激等难以消化的食物。