结肠镜检查是不能打麻药的，因为进行麻醉以后，患者痛觉处于未知状态，而结肠镜检查会有三个明显的生理弯曲，如果肠镜镜头通过生理弯曲而出现穿孔，甚至是局部损伤时，患者由于麻药作用而没有痛觉，有可能导致病情加重或者延误病情。

所以电子肠镜检查一般是有痛检查，但是疼痛患者一般可以忍受，如果疼痛剧烈，也可以让医生停止检查，有可能是由于局部肠道扭转或者患者过于紧张而导致。