大多数的直肠息肉在早期发现时都是良性的，如果直肠息肉在电子肠镜下有恶变的可能性，或者取局部的病检化验以后，有恶变倾向的，首先需要进行全面的盆腔核磁，以及周围局部淋巴结的检查以及扫描，查看是否存在转移，如果属于早期原位癌，需要将局部的病灶全部切除干净，并且需要做好定期复查。

恶性的直肠息肉一般称为腺瘤或者是直肠癌，需要通过手术切除，以及适量的放疗或者化疗才可以完全治疗，如果是早期的原位癌，那么术后五年的生存率可能会超过90%左右。