肛周脓肿如果自行破溃流脓以后，一般来说不会自愈，因为自行破溃以后已经形成了肛瘘，无论是肛周脓肿还是肛瘘，都需要通过手术治疗，手术治疗是唯一治愈的方法。

肛周脓肿破溃以后，虽然局部的疼痛减轻，但是感染灶不会自行去除，还需要手术将感染灶打开，并且将局部的创面进行进一步的去除和清创。

如果形成典型肛瘘，还需要进行括约肌的挂线，保留括约肌功能的前提下，将局部的瘘管壁以及内口和外口一并处理干净，这样才能达到治愈的效果，单纯的自行破溃可能不能缓解症状，只能起到暂时性止疼。