宫颈囊肿基本不会恶变，但是宫颈囊肿周围的宫颈糜烂面如果继发HPV感染，长期病情进展有可能会并发宫颈癌。也就是俗称的宫颈囊肿恶变。

宫颈癌要给与相应的特异治疗，所以对于宫颈囊肿，尤其是宫颈囊肿并发宫颈糜烂，要定期检查宫颈TCT和HPV，如果有明显异常，要进一步做阴道镜下宫颈多点活检，以明确诊断，如果发现有宫颈癌前病变，要及时给予治疗，阻断在癌前病变阶段。如果不给予治疗，病变逐渐进展，有可能转变为宫颈癌。