经期同房会增加妇科疾病的发生，尤其是各种感染性疾病。经血是细菌培养基，经期同房很容易导致感染，而且近期宫颈管扩张，感染容易逆行通过宫颈管进入宫腔，再通过输卵管进入盆腔，会显著增加盆腔炎的发生。

经期同房后，如果一旦出现分泌物异味，或者腹痛、发热等异常表现，一般表示有感染，要及时给予抗生素抗感染治疗，经期同房也容易增加经血逆流，增加子宫内膜异位症的发生。