肛门局部出现肛周脓肿的早期症状，主要是以肛门局部不明原因的疼痛最为多见，一般患者发病之前会有腹泻病史，腹泻分泌物停留于肛隐窝处，刺激肛窦反复感染，从而导致局部脓腔形成。

早期由于脓腔形成不典型，所以肛门局部皮肤肿痛或者红肿发硬最为多见，到了疾病发展的中期，有可能形成脓腔或者有脓液生成，患者局部的疼痛会更加严重，并且伴随有跳痛，甚至会出现全身体温升高的情况，建议尽早进行手术。