桥本甲状腺炎是一种自身免疫性疾病，它是由于机体内部产生的一些针对本身甲状腺的破坏性抗体，比如抗过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体，这两种抗体能够破坏自身的甲状腺，使得甲状腺功能下降，导致甲状腺功能减退的发生。

它跟缺碘没有太直接的关系，但是有不少的学术文章说研究发现，缺硒元素可能跟桥本氏甲状腺炎的发生有一定的关系，但这些只是一些学者的观点，所以桥本氏甲状腺炎跟缺碘没有太大的关系，它主要是一种自身免疫性的疾病。