首先桥本氏甲状腺炎和甲亢的病因不同，桥本氏甲状腺炎是一种自身免疫性的疾病，甲状腺组织中有淋巴细胞的浸润，导致了甲状腺细胞的凋亡。 而甲状腺功能亢进症，指的是甲状腺本身产生了甲状腺激素过多，而引起的高代谢症状和甲状腺毒症。 其次两者的转归不同，桥本氏甲状腺炎是一种慢性发展的疾病，有一部分病人在病情的终末期会出现甲状腺功能减退的情况。 而甲状腺功能亢进症，如果不经治疗，病情会一直发展，甲状腺功能亢进的情况会越来越严重。