有些急性肾盂肾炎特别容易出现复发，复发是指原先的致病菌再次引起急性肾盂肾炎发作，通常是指停药一个月以内发生，引起急性肾盂肾炎复发的原因也是非常多，可能的原因有尿流不畅，这是导致复发的原因之一，还有抗菌药物选用不当或者剂量疗程不足。不少尿路感染复发的致病菌为变形杆菌、铜绿假单胞菌这些少见的细菌，因此在用这些药物进行治疗的时候往往需要较大的剂量，疗程至少六周，还有病灶类抗菌药的浓度不足，也是导致急性肾盂肾炎复发的原因。