肛瘘以及肛周局部脓肿最佳的治疗方法是手术治疗，手术治疗也是唯一可以治愈的方法，如果单纯地使用药物保守治疗，只能缓解局部炎症症状，并不能起到彻底治愈的目的。

手术方式主要是以切开挂线术为主，将局部的感染灶以及括约肌挂线，通过结扎线的慢性切割和引流作用，保护括约肌肛门的情况下，将局部的感染灶去除干净，并且术后还需要注意对局部伤口进行消毒和引流，做好换药工作，避免局部伤口引流不畅而引发感染或者是复发，术后半年以内建议患者不要吃辛辣刺激的食物。