无痛胃肠镜检查是在浅睡眠状态下进行的，因此是无痛苦的，患者不会感到难受。普通胃镜检查，绝大多数患者能会有不适的一些感觉，部分患者而且很难做到配合医生进行检查。普通肠镜的检查大部分患者是可以配合医生进行检查的，多数患者会认为有腹部胀痛的感觉，但是是可以耐受的，少部分患者不能耐受，具体哪一项更加难受，这种情况比较主观，没有办法进行一个统一的回答患者，需要自己根据自己的情况进行一些判断。