直肠镜检查时会有肛门局部的异物感以及填塞感，没有明显的疼痛感，所以痛苦程度并不是非常严重，通过直肠镜主要是检查直肠和乙状结肠阶段的肛门局部和肛管内是否存在器质性的病变，常见的器质性病变主要有直肠炎症性疾病、直肠息肉以及直肠肿瘤，是常见的临床上检查直肠段疾病的主要检查方式之一。

如果怀疑有肠道其他病变时，还可以配合电子结肠镜检查来明确诊断，直肠镜检查时，一般需要在肛门口涂抹石蜡油或者其他润滑类制剂，进行润滑辅助检查的措施，所以检查时由于润滑油起到了润滑的作用，患者不会感到非常的痛苦。