系统性红斑狼疮是一种多系统损害的慢性自身免疫性疾病，其血浆中具有多种以抗核抗体为代表的多种自身免疫抗体。它好发于育龄期的女性，以20到40岁的女性最为多见。病因尚不明确，只是专家研究可能和遗传、环境因素、雌激素这些因素有关。有遗传学资料表明，系统性红斑狼疮第一代亲属患有系统性红斑狼疮的，第二代的发病率是明显增高的；环境因素，有阳光紫外线的照射、药物、化学试剂、微生物可以诱发本病。和雌激素有关系，也就是为什么是女性发病率明显比男性高的原因。

系统性红斑狼疮的发病原因至今仍然是不清楚的。大量研究显示遗传、内分泌、感染、免疫异常和环境因素与红斑狼疮的发病有关。遗传因素在流行病学调查中发现，HLA一些等位基因与狼疮的发生有关，补体基因缺陷在狼疮患者明显增高。另外，一些凋亡基因的异常形成细胞凋亡的信息，导致耐受或失活，在机体内失去作用，造成活化的TB淋巴细胞寿命延长，数量明显增多，产生大量自身抗体。此外在环境因素里面，像紫外线的照射、药物的应用以及病毒感染，这属于感染因素，包括EB病毒、疱疹病毒等等也与红斑狼疮的发病有关系，雌激素水平在狼疮的发病机制中也起到了一个重要的作用。除此之外，以上多种因素联合的效应诱发了自身免疫性疾病，各种自身抗体与相应的抗原形成了可溶性的免疫复合物，在补体的参与下沉积于靶器官，比如肾脏等等这些器官，造成全身血管及相应组织器官的炎性反应，引起了红斑狼疮的损害。