幽门螺旋杆菌阳性代表了已经感染了幽门螺旋杆菌，幽门螺旋杆菌目前已经被证实是引起慢性胃炎、消化性溃疡，甚至胃癌等疾病的最主要的病因。

如果为阳性的话，需要进行幽门螺旋杆菌的根除治疗，根除治疗是根据第五次全国幽门螺旋杆菌治疗的共识意见来进行的。具体的治疗方法是一个质子泵抑制剂加两种抗生素，再加一个铋剂，总共治疗14天。一般经过14天的治疗，大部分的幽门螺旋杆菌会转化为阴性，需要在停药一个月以后复查碳14呼气试验，明确是否转化为阴性，如果为阴性的话，则代表已经根治成功。