怀孕三个月，没有胎心，如果孕囊比较大，考虑是胚胎停育。

胚胎停育的原因主要有胚胎自身染色体异常，女性免疫抗体阳性，体内激素水平异常，精子畸形，女性在孕早期应用药物或接触射线或有害化学物质，生殖道的炎症，孕早期的病毒感染等。

如果孕囊比较小，要考虑是否月经推迟，排卵晚受孕晚引起的没有胎心。可以根据孕早期的B超，月经周期，孕早期的HCG数值，推算看是否正常。如果确诊胚胎停育，建议流产，不建议长时间等待。