嗓子疼，伴有头疼，需要考虑以下两种情况。

一、感染诱发血管性头痛、嗓子痛，可能是有上呼吸道的感染，可能是病毒感染，也可能是细菌感染感染，常常可以伴有发热，或者诱发血管调节功能紊乱，导致继发性的血管性头痛，又称为感染后头痛，患者没有阳性体征，头颅CT或核磁共振检查也没有异常发现，给予抗感染治疗，以及止痛对症处理即可。

二、感染所诱发的中枢神经系统炎症，有时候上呼吸道的感染病毒或者细菌感染，可能累积中枢神经系统，在出现嗓子发炎的同时，也出现脑炎或者脑膜炎的症状，头痛会伴有恶心、呕吐，有一定程度的高颅压症状，查体有颈项强直、克氏征及布氏征阳性，腰穿检查可以发现细胞数明显升高，压力升高，核磁共振检查和CT检查一般没有异常发现，也可能会发现脑膜有轻度强化，治疗上有脱水、降颅压以及抗感染处理。