牙髓炎根管治疗是很疼的，首先牙髓炎本身就很疼痛，细菌感染达到牙神经，引起牙神经的一个剧烈的反应。在牙神经根管治疗的过程中，首先要进行牙神经的摘除，摘除牙神经可以在局部麻醉下进行，或者是杀神经治疗。如果是杀神经的话，那么在神经杀死的过程中，也就是使用失活剂作用于牙髓组织，使牙髓组织坏死的过程中会有疼痛，根据个人的体质不同。如果杀神经之后，牙齿已经被取出进行根管封药，那么根管的药物也会刺激牙根的神经，根尖区也会出现疼痛。根管治疗也是根管充填的最后一个环节，根管充填的过程中在充填物如果超出根尖孔也会出现疼痛。