肾积水的病因，分为先天性，后天获得性和外来病因这几种情形，其中，后天获得性最为常见，主要指的是泌尿系统的结石堵塞输尿管，造成肾积水，炎症或者缺血损伤，造成输尿管的疤痕形成，也可以导致肾积水，肾盂和输尿管的肿瘤息肉，也可能会引起排尿不畅引起积水，

外来的病因主要包括腹膜后脏器的病变，比如腹膜后的脓肿出血肿瘤，盆腔的肿瘤，比如直肠癌，

先天性的病因中主要指的是，内在性的输尿管的狭窄，异位的血管压迫，输尿管高位开口等这些情形比较少见。