急性肠胃炎发烧38℃，这时候有可能是因为感染性的肠胃肠炎所导致的发烧，需要尽早到正规医院的消化内科或者肠道门诊就诊，完善血常规检查、大便检查，以及完善C反应蛋白等等，明确是否存在感染性疾病。

如果白细胞增高，中性粒细胞比例增高，大便中发现有白细胞、脓细胞等等，表示患者发热是因为感染因素所导致的，需要使用抗生素治疗，可以考虑口服中成药的抗生素，比如黄连素片，也可以考虑口服诺氟沙星、左氧氟沙星等等药物进行治疗。同时也需要使用蒙脱石散等等止泻治疗，要补充体内丢失的水分，以及调节肠道菌群治疗。

（药物的使用需在医师指导下进行）