胃肠功能紊乱和肠癌的区别在于，胃肠功能紊乱是功能性疾病，肠癌是器质性疾病，两者的原因不同，症状不同，治疗的方式也是截然不同的。

功能性的胃病、肠病可以使用一些调整患者的情绪、日常生活的调整，就能够得到很好的治疗效果。肠癌就需要尽早的完善手术治疗，手术以后辅助给予放疗、化疗、中医中药综合治疗的手段进行治疗。胃肠功能紊乱和肠癌的主要鉴别在于肠镜的检查，通过肠镜的检查以及病理组织学的检查，可以明确相关的诊断。