肚脐出现发臭并伴有疼痛，一般临床上最多见的两类原因：

第一类原因就是比较常见的脐炎，也就是脐周围由于细菌感染导致的。由于肚脐是皮肤皱褶比较多的地方，而且很多人有抠肚脐眼的坏习惯，这样破损的皮肤在细菌的侵袭下就容易造成局部周围皮肤软组织感染，造成一些渗出，产生一些臭味和疼痛；

第二种原因也可能是由于一些先天性的脐尿管瘘，由于脐尿管瘘不能够有效地闭合，往往在肚脐周围出现一些尿液，那么这种情况就会产生异味，出现反复刺激性的疼痛，也是临床上引起这类疾病的主要原因。