肚脐眼流水有臭味并不是肠胃不好，主要有以下几种原因：

第一种情况，可能是由于肚脐眼局部周围感染造成的肚脐周围炎症，就会在细菌繁殖出现一些渗出，伴有异味等情况，这种情况在临床当中多数是由于患者有抠肚脐眼的习惯，细菌乘虚而入，导致了局部感染，甚至包括化脓的情况。

第二种原因，有可能是一些先天性的疾病，叫做脐尿管瘘，长期反复的一些尿液通过细小的管道从肚脐周围流出，由于尿液与皮肤皱褶之间的一些细菌、灰尘相互包绕，容易造成臭味的情况。因此出现这些情况，都应该及时的到医院进行治疗。