胃肠功能紊乱的患者不会影响月经的，但是胃肠功能紊乱有可能是因为患者情绪紧张、心情焦虑以及悲伤等等情绪所影响的。出现以上的情绪，就有可能会影响月经。

所以胃肠功能紊乱的患者也有可能会合并月经的失调，出现胃肠功能紊乱同时月经失调，患者要积极的查找原因，同时可以酌情的使用一些抗焦虑的药物进行治疗，比如氟哌噻顿美利曲辛片。当然，具体药物的选择以及用法用量要遵医嘱执行。