肛门长疙瘩并不会自愈。

肛门长疙瘩可能是肛门息肉、肛乳头瘤肥大脱出，也可能是外痔、尖锐湿疣引起的，这些疾病都不能自愈，是需要采取手术以及药物治疗才能治愈。

所以患者在出现肛门长疙瘩的情况下，一定要去医院的肛肠外科完善相关检查，比如肛门镜检查以及局部分泌物检查来确诊病因，然后针对性的进行治疗。对于外痔，如果患者没有症状可以暂时不处理，平时多做提肛运动。

而对于肛周尖锐湿疣是需要尽早的采取电刀灼烧，配合重组干扰素a2b凝胶等药物进行外涂，来抗病毒治疗，禁止性生活。而对于肛门息肉以及肛乳头瘤肥大是需要采取手术切除的。

（用药请遵医嘱）