乳糖不耐受的患者，有可能会出现腹胀、肠鸣音亢进、肠绞痛、腹泻、恶心、呕吐等胃肠道的症状。

当然，也有一部分的患者胃肠道的运动功能减弱，从而出现便秘的症状，乳糖不耐受的患者出现以上症状的严重程度和进食的乳制品的量有一定关系，因此，也有少部分患者进食了可耐受的一定量乳制品，不会出现明显的症状，具体可耐受的量也是因人而异。

婴幼儿乳糖不耐受最常见的症状就是腹泻，典型的粪便为黄色的稀便。