化脓性扁桃体炎是一种相对较为严重的咽喉部的感染性的疾病，主要是细菌感染，包括溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌。化脓性扁桃体炎在发烧退烧之后出现咳嗽，表明炎症没有控制，甚至炎症向下发展影响了气官，导致了气管炎可能。所以在化脓性扁桃体炎出现这种症状的时候，要继续的给予抗感染的治疗，同时可以使用一些止咳药物进行对症的治疗。总而言之，化脓性扁桃体炎的治疗时间或者是疗程，要相对较长，以免感染扩散或者是治疗不彻底。