肠瘘高位和低位区分，一般情况下是以屈氏韧带为界，屈氏韧带以内100cm者为高位肠瘘，其余为低位肠瘘。

一般情况下，高位肠瘘和低位肠瘘发生病理生理改变是不一样的，高位小肠瘘可以丢失4000-5000mL，肠瘘的部位不同，所造成的电解质紊乱也有所不同，瘘的部位越高，丢失的肠液中氯越多，故越形成低钠、低钾、低氯以及代谢性碱中毒。而低位的小肠瘘多导致低钠、低钾以及代谢性酸中毒。

对于治疗的效果也有所不同，一般情况下低位瘘或者是小瘘可以有自行愈合的机会；而对于高位的肠瘘大多数不能自行愈合，需要通过手术的办法。