唇腭裂是一种常见的畸形，好发于胚胎形成的前12周，目前发病原因还没有十分明确，不过是和以下因素有关系的。首先是遗传因素，遗传因素在唇腭裂中占有一定的关系，有的认为也属于一种多基因的遗传性疾病。除此之外，唇腭裂也和营养因素有关系，如果在怀孕期间出现了维生素的缺乏，主要是维生素A或者是B2缺乏，或者是叶酸缺乏等，都会引起唇腭裂。其次，唇腭裂也和感染因素有关，在怀孕期间感染了某些病毒，都会引起唇腭裂的发生。有时唇腭裂也可能是在母体怀孕期间进食了药物，比如说进食了抗组胺类药物，也会引起唇腭裂的发生。有时唇腭裂也是和吸烟、喝酒等有关系。