急性肾盂肾炎很少会出现头疼的症状，但是这种情况也有可能会发生，因为急性肾盂肾炎毕竟是上尿路感染，会引起炎症反应，而且这种炎症反应常常是全身性炎症反应，表现出发烧，有的患者体温甚至能够高达40℃，还可能会出现乏力、头晕等症状，头疼也可以视为全身炎症反应的一种。

所以，急性肾盂肾炎急性期患者的确有可能会出现这样的症状，不过也不能因为这样的症状就忽略了其他可能导致头疼的原因，比如脑出血、脑梗塞、蛛网膜下腔出血、颅内的占位、功能性的头疼、偏头疼、血管性头疼等其他的可能病因。