睡醒肚子疼一般最常见的原因是睡觉时受凉引起的不适症状，属于生理性的，问题不大，所以说也不用担心。建议注意休息，注意保暖，特别是睡觉时，保护腹部不受凉，一般一到两天就可以恢复，如果不恢复或者是加重是需要排除其他器质性疾病，比如肠炎、阑尾炎等，之后定期复查即可。