腓骨囊肿如果局部的囊肿较小，尚未超过3cm，局部不会有任何的不适等症状，当然也不完全绝对。腓骨囊肿如果达到3~5cm以上或更大者，局部会出现疼痛，以及甚至出现局部皮肤肿胀的情况，除此以外，会出现活动受限以及行走疼痛加重的症状。

部分患者如果是一些特殊的人群，如运动员以及跑跳等人群，其症状还会更加的明显，不排除在运动过程当中出现骨折的可能。