急性心肌炎是心肌的炎症性疾病，它主要的病因是病毒感染，包括柯萨奇B病毒是最常见的病毒，另外还有人类腺病毒、流感病毒、风疹病毒等等，都能够引起。另外还有细菌、真菌、螺旋体等感染，也可以引起心肌炎，但相对少见。非感染性的心肌炎的病因，包括药物、放射、结缔组织病、血管炎等，这些都能够引起心肌炎。

它的发病可以由于病毒的直接作用，使得心肌的损伤，也可以因为病毒与机体免疫反应共同作用，导致心肌和微血管的损伤，从而引起心肌的组织结构和功能的改变。