在临床上，可以导致上颚肿痛的原因是非常多的，并且大多数都是病理性的因素，例如比较常见的牙周疾病是导致上颚肿痛，最常见的原因之一，例如牙龈炎、牙周炎等。

另外一些口腔黏膜疾病也会导致上颚发生肿痛，还有一些患者出现上颚肿痛，可能是由于外伤造成的，比方说吃一些尖锐或者坚硬的食物。

另外口腔中卫生环境比较差，不良的饮食习惯以及经常吸烟，经常酗酒都有可能会导致患者上颚肿痛的症状。