肺小结节三毫米是否会自愈要看引起肺结节的原因。如果这种结节是因为长期抽烟或者接触粉尘所引起，这种情况下一般在戒烟或者脱离粉尘环境之后，有可能会自愈。

还有一种情况，如果结节是因为慢性炎症刺激所导致的在通过口服一些消炎药物之后，也有可能会自愈。

临床上大部分的结节是不可能会自愈的，但是也不要过于担心，因为大部分的结节在临床上都是以良性的病变为主，只有极少部分的结节是早期的肺癌，但是出现有肺结节也需要定期复查肺部CT，观察结节的形态和体积有无变化。