儿童良性癫痫的原因比较多，有明显的遗传因素。往往发生在小儿某一个特定的发育时期，由于局限疾病所致，其预后是比较良好的。往往这类的患儿其发作可能由于结节性硬化、脑三叉血管瘤病以及神经纤维瘤病导致的。

颅内感染，如病毒性脑炎、细菌性脑膜炎以及结核性脑膜炎都可以诱发小儿良性癫痫，所以一旦确诊后要进行早期的干预治疗，避免症状反复加重，也要定期复查脑电图了解癫痫用药和治疗的效果。