雷特综合症往往这些话而伴有明显的智力障碍，或神经发育的倒退，在早期可能会出现注意力减少，对玩具的兴趣减低，学习和运动能力比较差，并且头围增长比较缓慢，有孤独症样的临床表现。

部分患儿还可能会出现过多的双手运动，并且发育停滞会越来越明显，往往喜欢表现为拍手、吮吸手指这类的刻板性的手动作，入睡后症状消失，并且还会有呼吸节律不规则，有阵发性的过度通气以及呼吸频率增快。出现这种情况需要早期的进行诊断，并进行康复训练。