狭颅症手术有没有后遗症，取决于狭颅症的类型、严重程度和术后的并发症。对于简单类型的狭颅症，得到积极有效的及时治疗，可能不会留下特别严重的后遗症。

对于综合征类型的狭颅症，或者是治疗时间很晚，已经造成了不可逆的脑组织功能障碍，可能会出现相关的神经功能障碍的一些后遗症，像发育落后、智力的显落后、癫痫等等。这种手术相关的后遗症往往就是，手术以后可能会出现骨瓣的畸形愈合，或颅骨的吸收、缺损，还有一个是颅缝的再次提前闭合。如果再次闭合以后，再次严重影响脑组织的发育，对于这部分病人，可能需要再次的手术治疗。