宝宝在睡觉的时候摇头，首先要注意检查孩子有没有出汗比较多，有没有枕秃，这些往往是缺乏维生素D的表现，如果缺乏维生素D，孩子在睡觉的时候容易出现多汗，多汗会刺激头皮痒，孩子就会表现出摇头，应当给孩子及时补充维生素D。

另外，还要注意检查孩子的头皮里有没有皮疹，如果头皮里、颜面部有皮疹，皮疹也可以刺激出现痒感，孩子就会表现为摇头。同时还要注意检查孩子有没有倒睫，有没有外耳道湿疹、外耳道流脓等情况，因为这些耳鼻喉科和眼科的疾病也会导致孩子出现睡眠摇头。

其他疾病还要注意是不是抽搐发作，如果孩子同时伴有肢体的抖动，还要看孩子的精神状态和运动发育情况，如果存在运动发育落后、智能落后，要鉴别是不是抽搐发作，可能需要完善相关的检查来明确。