扁桃体从本质上是人体的一个免疫器官，对于正常的扁桃体，是不建议进行切除的，临床上切除的扁桃体往往都是病灶性扁桃体，所谓病灶性的扁桃体，就是在切除之前扁桃体已经无法通过药物治疗或者其他的办法进行挽救，因此切除它之后，严格的说对人体只有好处没有坏处。

但是扁桃体作为人体的一个免疫器官，或者是一个正常的组织，在切除之后，在长期的随访过程中还会有略微的并发症，例如儿童时期的扁桃体切除之后，到成年以后，尤其是到40岁或者50岁以后，切除侧的咽部，有的人会感觉到发干，或者有的患者会说扁桃体切除之后，扁桃体不疼了，每次发炎的时候舌根疼。

这种情况下往往是因为扁桃体切除不全，扁桃体下极还有残留的淋巴组织导致的，对于这种情况，应该不能认为是一种后遗症，应该是一种手术的残留。