益生菌有调节和改善胃肠道功能，维持健康的肠道菌群，预防和减少腹泻，提高机体免疫力的功能，主要对骨质疏松、胃肠道健康、增强免疫力起到重要作用。

它还可以促进维生素D和铁元素的吸收，有效降低血氨浓度，提高体内蛋白质积蓄，提高蛋白质的消化吸收率。婴儿期补充益生菌，还有可能缓解乳糖不耐受和特异性湿疹症状的发生。益生菌虽然益处很多，但不提倡长期服用，长期服用会破坏人体肠道菌群的自身调节，反而不利于健康，建议多从天然食物来补充益生菌。